处理设有抵押权的闲置土地时，这是一个涉及政府、抵押权人及土地使用者（抵押人）多方利益的复杂问题，需要遵循相关法律法规，并确保各方权益得到妥善保护。以下是对此问题的详细解答：
一、闲置土地的定义与法律依据
闲置土地，根据《中华人民共和国土地管理法》及《闲置土地处置办法》，指的是国有建设用地使用权人超过合同或划拨决定书约定的动工开发日期满一年未动工开发的土地。处理这类土地的主要法律依据包括《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国城市房地产管理法》以及《闲置土地处置办法》。
二、闲置土地的认定与分类处置
调查与认定：
- 土地管理部门需依法对土地是否闲置进行调查，明确闲置的原因和时间。
- 同时，需调查土地上抵押权的设立情况，包括抵押权人、抵押金额、抵押期限等关键信息。
分类处置：
- 因政府原因导致闲置：政府应与抵押权人、土地使用权人共同协商解决方案，如延长动工期限、调整土地用途等，并确保抵押权益不受损害。
- 因土地使用者自身原因导致闲置：
- 若土地未动工开发满一年，政府可向土地使用权人下达《征缴土地闲置费决定书》，按照土地出让或划拨价款的百分之二十征缴土地闲置费。
- 若土地未动工开发满两年，政府可依法无偿收回土地，并向土地使用权人下达《收回国有建设用地使用权决定书》。在收回土地前，需妥善处理抵押权，确保抵押权人的优先受偿权。
三、抵押权人的权益保障与行使
关注土地动态：抵押权人应密切关注抵押土地的状态，通过有效渠道了解土地闲置情况及政府处置动向。
行使权利维护权益：
- 若土地闲置影响抵押权益，抵押权人有权要求抵押人提供额外担保或采取措施解决闲置问题。
- 在政府处置闲置土地过程中，抵押权人有权参与并表达意见，确保自身权益不受损害。
- 当政府收回闲置土地并处置所得价款时，抵押权人有权优先受偿。
四、设有抵押权的闲置土地处理流程
- 闲置土地认定：由市、县国土资源主管部门负责进行认定。
- 拟订处置方案：在拟订方案时，应书面通知抵押权人并充分听取其意见。
- 报请批准：处置方案需报经有批准权的人民政府批准。
- 下达决定书：向土地使用权人下达相关决定书，并抄送抵押权人。
- 债务处理：若土地被司法机关查封，政府在收回前需结清债务及利息，并解除查封。
五、实际操作中的注意事项
- 严格遵循法律程序：政府应确保整个处理过程符合法律法规要求，决策合法有效。
- 加强沟通协调：与抵押权人保持密切沟通，充分听取其意见和诉求，确保处理方案得到各方认可。
- 实现权益平衡：在保障政府土地管理权的同时，充分考虑抵押权人和土地使用者的合法权益，实现各方权益的平衡与保护。
综上所述，处理设有抵押权的闲置土地时，需依法进行、注重沟通协调、保障各方权益。政府、抵押权人及土地使用者应共同努力，推动问题的妥善解决。