当借款利息超过本金时，法院的处理方式会遵循法律法规，并确保公正裁决，以保护当事人的合法权益。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与审查原则
法律依据：
- 《中华人民共和国民法典》明确禁止高利放贷，规定借款利率不得违反国家有关规定。
- 《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》也明确指出，借贷双方约定的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。
审查原则：
- 法院会首先审查借款合同的有效性，包括是否存在欺诈、胁迫等法定无效情形。
- 接着，法院会仔细查看合同中关于利息的具体约定，如计算方式、利率标准等，并依据相关法律规定判断其合法性。
二、具体处理方式
计算合法利息范围：
- 法院会根据合同成立时的一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍来计算合法利息的上限。
- 如果实际支付的利息超过了这个上限，那么超出部分的利息将不受法律保护。
处理已支付和未支付的超额利息：
- 对于已经支付的超出法定利息的部分，借款人可以请求出借人返还，法院会根据具体情况予以支持。
- 对于尚未支付的超出法定利息部分，法院不会判决借款人继续支付，以保护借款人的合法权益。
复利问题的处理：
- 如果借款合同中约定了复利，法院会严格审查其合法性，并根据具体情况作出判断。
综合考虑其他因素：
- 法院在处理案件时，还会综合考虑借款人的还款能力、借款用途、出借人的行为是否存在恶意等因素，以确保裁决的公正性。
三、示例说明
假设甲向乙借款10万元，约定年利率为36%，借款期限为一年。合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）为3.85%。根据法律规定，合法利息的上限为LPR的四倍，即15.4%。因此，甲应支付的合法利息为1.54万元。如果甲实际支付了3.6万元的利息，那么超出的2.06万元将不受法律保护，甲有权要求乙返还。
四、建议与措施
- 收集证据：借款人应妥善保管借款合同、还款记录等相关证据，以便在必要时维护自己的权益。
- 友好协商：在诉讼之前，双方可以尝试通过友好协商的方式解决争议，对还款金额和方式进行适当调整。
- 寻求法律帮助：如果协商不成，借款人应及时寻求法律专业人士的帮助，向法院提起诉讼，以确保自身合法权益得到有效保护。
综上所述，当借款利息超过本金时，法院会依据相关法律法规和案件具体情况进行处理，以确保裁决的公正性和合法性。借款人应充分了解自己的权益和法律规定，并采取合适措施维护自身合法权益。