在刑事案件中，若犯罪嫌疑人有重大嫌疑但公安没有真正证据，处理方式会严格遵循法律规定。以下是详细分析：
核心结论：
侦查机关应继续深入调查：即便嫌疑人嫌疑重大，但在没有确凿证据的情况下，侦查机关仍需全面、深入地收集证据，运用现场勘查、走访调查、检验鉴定等多种手段，力求形成完整的证据链。
遵循法定程序：在收集证据的过程中，必须严格遵循法定程序，确保证据的合法性和有效性，同时保障嫌疑人的合法权益，避免出现非法证据。
不同阶段的不同处理：
- 侦查阶段：若多方侦查后证据仍然不足，侦查机关可能会决定撤案。
- 审查起诉阶段：检察院在审查案件时，若发现证据不足，可以决定不起诉。
- 审判阶段：法院在审理案件时，若认为证据不足，应依法判决被告人无罪，落实“疑罪从无”的原则。
法律背景与解释：
- 刑事案件的处理必须严格遵循“以事实为根据，以法律为准绳”的原则。在没有确凿证据的情况下，不能轻易对嫌疑人定罪。
- 侦查机关有责任和义务全面、深入地调查案件，收集足够的证据来支持或反驳嫌疑人的罪行。
- “疑罪从无”是刑事诉讼法的重要原则之一，旨在保护嫌疑人的合法权益，防止冤假错案的发生。
法律建议：
- 对于嫌疑人而言，应积极配合侦查机关的调查工作，同时也有权要求侦查机关依法办案，保障自己的合法权益。
- 若嫌疑人认为自己受到不公正对待或权益受到侵害，可以依法向有关部门反映情况或寻求法律援助。
综上所述，当犯罪嫌疑人有重大嫌疑但公安没有真正证据时，侦查机关应继续深入调查并严格遵循法定程序。在不同阶段，根据证据情况，会有不同的处理方式。嫌疑人应积极配合调查并依法维护自己的权益。