结论前置：劳动合同中约定加班费基数是有效的，但应确保该约定不低于当地最低工资标准，并且合理反映劳动者的正常工资水平。具体确定加班费基数时，需综合考虑劳动合同、集体合同、实际工资情况及法律法规的规定。

一、劳动合同约定加班费基数的有效性

用人单位与劳动者在劳动合同中约定加班费计算基数，通常是被认为有效的，前提是该约定不违反法律法规的强制性规定，且不低于当地最低工资标准。这种约定有助于明确双方权利义务，减少因加班费计算而产生的争议。

二、加班费基数的确定原则

1. 劳动合同优先：如劳动合同中明确约定了加班费基数，且该基数不低于当地最低工资标准，则按约定执行。

2. 集体合同补充：若劳动合同中未约定或约定不明确，且存在集体合同，则按集体合同中关于加班费基数的约定执行。

3. 实际工资情况：当劳动合同和集体合同均未约定时，加班费基数应基于劳动者的实际工资情况确定，通常包括基本工资、岗位工资等固定收入部分，但不包括加班工资、特殊劳动条件下的津贴以及非劳动报酬性质的福利。

4. 法定最低标准：无论何种情况，加班费基数均不得低于当地最低工资标准。

三、加班费基数的具体确定方法

• 如劳动合同或集体合同中有明确约定，且该约定合理（如不低于劳动者正常出勤工资的70%），则按约定确定。
• 如无明确约定，则根据劳动者实际获得的月收入，扣除非常规性奖金、福利性、风险性等项目后的正常工作时间的月工资确定。
• 如工资系打包支付，或双方形式上约定的“正常工作时间工资”标准明显不合常理，可参考实际收入×70%的标准进行适当调整。

四、加班费计算示例

假设某劳动者的月工资为5000元，其中基本工资为4000元，岗位津贴为1000元，无其他非常规性奖金或福利。若劳动合同中约定加班费基数为基本工资，即4000元，则：

• 工作日加班：加班费 = 4000元 / 21.75天 / 8小时 × 加班时数 × 150%
• 休息日加班：加班费 = 4000元 / 21.75天 / 8小时 × 加班时数 × 200%（如不能安排补休）
• 法定节假日加班：加班费 = 4000元 / 21.75天 / 8小时 × 加班时数 × 300%

五、注意事项

• 用人单位应确保加班费基数的约定合法、合理，避免引发劳动争议。
• 劳动者在签订劳动合同时，应仔细审查加班费基数的约定，确保自身权益得到保障。
• 如对加班费基数存在争议，双方可协商解决；协商不成的，可依法向劳动监察部门投诉或提起劳动争议仲裁。