行政复议机关审查发现申请人行政复议被申请人不适格时，应当驳回行政复议申请。具体法律依据及处理流程如下：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国行政诉讼法》第二十六条明确规定了行政诉讼中被告的确定原则，即作出行政行为的行政机关是被告。在行政复议中，若被申请人并非作出原行政行为的行政机关，或不具备相应的行政职责，则其作为被申请人是不适格的。
   • 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第二十六条进一步规定，原告所起诉的被告不适格，人民法院应当告知原告变更被告；原告不同意变更的，裁定驳回起诉。这一规定同样适用于行政复议程序，即行政复议机关在审查中发现被申请人不适格时，应告知申请人变更被申请人，若申请人不同意变更，则应驳回行政复议申请。

2. 处理流程：

   • 审查被申请人资格：行政复议机关在受理行政复议申请后，应首先审查被申请人的行政主体资格，即其是否具有作出被复议行政行为的法定职权。
   • 告知与变更：若发现被申请人不适格，行政复议机关应及时向申请人发出书面通知，告知其被申请人不适格的情况，并建议申请人变更被申请人。
   • 驳回申请：若申请人不同意变更被申请人，行政复议机关应依法驳回行政复议申请，并说明驳回的理由和依据。

3. 后续救济途径：

   • 申请人对驳回行政复议申请的决定不服的，可以依法向人民法院提起行政诉讼，请求法院对原行政行为及行政复议决定进行审查。
   • 在诉讼过程中，法院将根据相关法律法规及事实证据，对原行政行为及行政复议决定的合法性进行评判，并作出相应的裁判。

综上所述，行政复议机关在审查发现申请人行政复议被申请人不适格时，应依法驳回行政复议申请，并告知申请人相应的救济途径。若您对此类问题有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。