结论前置：不签三方协议，学校仍然有义务按照相关规定处理你的档案，不得以此为由拒绝保管或转递档案。
详细分析：
三方协议的性质：
- 三方协议是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，它明确了毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务。但需要注意的是，三方协议并非强制必须签订的，而是基于自愿原则。
档案管理的法律规定：
- 根据《普通高等学校学生管理规定》等相关法律法规，高校有义务按照国家有关规定为毕业生办理档案转递手续。这一过程中，不应与其他不合理的条件（如强制签订三方协议）相挂钩。
- 教育部也明确规定了“四不准”纪律，其中包括不准以任何方式强迫毕业生签订就业协议，也不得以户档托管为由劝说毕业生签订虚假就业协议。
档案的处理方式：
- 若你未签订三方协议，学校一般会按照既定的人事管理规则和就业政策处理你的档案。这可能包括将档案转回你的生源地人事部门，或者根据学校规定提供一定期限的档案暂存服务。
- 在某些情况下，如果你选择了暂缓就业，学校可能会继续保管你的档案一段时间（如两年），但具体政策需咨询学校相关部门。
你的权益保护：
- 你享有自主选择职业和处置个人档案的权利。学校以不签三方协议就不给档案的方式间接强迫你签订协议，是侵犯你权益的行为。
- 如果遇到学校以此为由拒绝办理档案转递手续的情况，你可以与学校沟通协商，要求学校按照规定正常办理。如果沟通无果，你还可以向学校的上级教育主管部门投诉。
综上所述，不签三方协议并不会影响学校对你的档案的保管和转递义务。学校应依法依规处理你的档案，而你也有权维护自己的合法权益。如果在这方面遇到任何问题，可以直接向我咨询。