公司不能以乱停放车辆扣员工工资。

首先，从法律角度来看，公司扣除员工工资必须有明确的法律依据或合同约定。在大多数情况下，员工乱停放车辆并不构成可以直接扣除工资的法定事由。工资是员工提供劳动后应得的报酬，公司无权随意扣减，除非有明确的法律规定或双方约定的扣款条款。

其次，如果公司认为员工乱停放车辆给公司造成了损失或影响了公司秩序，公司应该通过其他合法途径来解决这一问题，比如制定并执行相关的停车管理规定，对违规停放的车辆进行警告、罚款或采取其他合理的管理措施。这些措施应当在公司的规章制度中明确，并且需要经过合法的程序制定和公布。

最后，如果公司确实因为员工乱停放车辆而扣除了员工工资，员工有权向公司提出异议，并要求公司说明扣款的具体理由和依据。如果公司无法提供充分的理由和依据，员工可以向劳动监察部门投诉，维护自己的合法权益。

综上所述，公司不能以乱停放车辆为由直接扣除员工工资。如果公司采取了此类行为，员工应当积极维护自己的权益，必要时可以寻求法律援助。