法院把担保人认定为出借人在特定情况下是合法的。这一结论的得出，主要基于担保合同的性质、合同主体的认定原则以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
一. 担保合同的性质与主体认定
担保合同是为保障债权实现而设立的从合同，其主体通常包括债权人、债务人和担保人。在借贷关系中，出借人作为债权人，借款人作为债务人，而担保人则承诺在债务人无法履行债务时承担责任。然而，在某些情况下，担保人的身份可能与出借人重合，这就涉及到了合同主体的认定问题。
二. 合同主体的认定原则
在合同主体的认定上，法院主要依据合同内容、当事人的意思表示以及交易习惯等因素进行综合判断。如果担保合同明确约定了担保人的身份，并且该身份与出借人重合，那么法院在审查合同内容并确认当事人意思表示真实自愿的情况下，有权将担保人认定为出借人。
三. 相关法律法规的规定
虽然《中华人民共和国民法典》及相关司法解释并未直接规定法院可以将担保人认定为出借人，但根据《民法典》第六百八十一条的规定：“保证合同是为保障债权的实现，保证人和债权人约定，当债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的情形时，保证人履行债务或者承担责任的合同。”这一规定为担保合同的性质提供了法律依据，同时也暗示了担保人的身份可以根据合同约定和当事人意思表示进行灵活认定。
此外，《民法典》第四百六十五条规定：“依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。”这意味着，只要担保合同依法成立，并且合同内容不违反法律法规的强制性规定，法院就应当尊重当事人的意思自治，对合同主体进行准确认定。
四. 实际案例分析
在实际案例中，如果法院发现担保人在借贷关系中实际上扮演了出借人的角色，并且这一事实得到了合同内容、当事人意思表示以及交易习惯等证据的支持，那么法院就有权将担保人认定为出借人。例如，在某些借贷纠纷中，担保人可能以出借人的名义向借款人提供借款，并在担保合同中明确约定了自己的出借人身份。在这种情况下，法院就可以根据合同内容和当事人意思表示将担保人认定为出借人。
总结：
我建议：在涉及担保合同和借贷关系的法律纠纷中，当事人应当充分保留和提交相关证据，以便法院能够准确认定合同主体和各方权利义务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。