招标文件中约定中标人中标后支付前期已完成工程费用，这一约定的合法性需根据具体情况来判断。

1. 合同自由原则：

   • 在招标文件中约定中标人中标后支付前期已完成工程费用，首先体现了合同自由的原则。根据《中华人民共和国合同法》（虽已废止，但相关原则在《民法典》中得以延续）的规定，当事人有权依法自由订立合同，约定彼此的权利和义务。只要该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害社会公共利益，即应认定为有效。

2. 招投标法规定：

   • 然而，招投标活动受到《中华人民共和国招标投标法》等法律法规的严格规范。若招标文件中的此类约定违反了招投标法律法规的强制性规定，如影响了招投标的公平、公正原则，或构成了对投标人的不合理限制或歧视，那么该约定将被视为违法而无效。

3. 具体情况分析：

   • 若前期已完成工程是由招标人自行完成或委托第三方完成，且该费用是合理且必要的，那么在招标文件中约定由中标人承担这部分费用，可能被视为招标人选择中标人的一种条件，只要该条件不违反法律法规的强制性规定，即应认定为合法。
   • 但若前期已完成工程存在质量问题、费用不合理或招标人存在其他不当行为，那么此类约定可能引发争议，甚至被认定为无效。

4. 法律建议：

   • 对于招标人而言，在招标文件中设定此类条款时，应确保其内容合法、合理，并明确约定相关费用的计算标准、支付方式及时间等，以避免后续争议。
   • 对于投标人而言，在参与投标前，应仔细审查招标文件中的各项条款，特别是关于费用承担、支付条件等方面的约定，以确保自身权益不受损害。

综上所述，招标文件中约定中标人中标后支付前期已完成工程费用的合法性需根据具体情况来判断。若该约定符合法律法规的规定，且内容合理、明确，那么应认定为有效。若存在违法或不当之处，则可能引发争议或被认定为无效。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。