已开工的铁路项目若因故停工并需积极整改，应遵循以下步骤进行处理：

一. 分析停工原因

首先，需要对停工的原因进行深入分析，明确停工的责任方。这包括但不限于资金问题、工程难题、劳务纠纷、行政命令、设计变更、施工质量问题、未取得必要的施工许可或违反相关环保规定等因素。

二. 签署停工协议

在明确停工原因后，应与业主或相关方签署停工协议。该协议应详细列明停工的起始时间、预计的复工时间、停工期间的责任和义务分配，以及可能产生的费用和风险分担方式。签署协议时，应确保各方的利益和合法权益得到妥善保护，并明确停工期间的安全保障措施和质量维护责任。

三. 采取整改措施

根据停工原因，采取针对性的整改措施。例如，若因资金问题停工，应尽快协调资金以确保工程能继续进行；若因设计变更或施工质量问题停工，应及时与相关方协商解决或修改工程计划，并采取必要措施弥补或减少损失。

四. 工程保护与维护

在停工期间，必须采取有效措施对工程进行保护和维护，以防止因长期停工导致的工程质量下降或安全隐患。这包括但不限于对工程进行定期巡检、对易损部件进行保养或更换、对施工现场进行清理和整顿等。

五. 复工准备与申请

当停工原因消除并具备复工条件时，应及时恢复工程的施工。在复工前，应对工程进行全面的检查和评估，确保停工期间未发生任何影响工程质量和安全的不利变化。同时，应向相关部门提交复工申请，并按照要求办理相关手续。

六. 法律责任与纠纷处理

若停工期间涉及法律责任或合同纠纷，应依据合同条款和相关法律法规进行处理。例如，若因发包人原因致使工程中途停建、缓建，发包人应承担相应的违约责任，并赔偿承包人因此造成的停工、窝工、倒运、机械设备调迁、材料和构件积压等损失和实际费用。

• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第八百零三条和第八百零四条，发包人未按照约定的时间和要求提供施工条件或因发包人原因致使工程中途停建、缓建的，应承担相应的违约责任和赔偿责任。

我的观点：处理已开工的铁路项目停工并需积极整改的情况时，应全面考虑各方利益和合法权益，确保整改措施的有效性和合规性。同时，应加强沟通协调，及时解决可能出现的问题和纠纷，以确保工程能够顺利复工并完成。如有进一步需要，您可以继续咨询我。