在行政协议纠纷中，原、被告主体资格的确定对于案件的审理至关重要。以下是对原、被告主体资格的具体分析：

原告主体资格

在行政协议纠纷中，通常享有原告主体资格的是行政协议的相对方，即与行政机关签订行政协议的公民、法人或其他组织。当这些主体认为行政机关在履行行政协议过程中存在违约行为或侵害其合法权益时，有权作为原告提起行政诉讼。

具体来说，以下几种情形下的主体通常具有原告主体资格：

1. 行政协议的直接相对人：如某企业与行政机关签订了土地使用权出让合同，若行政机关未按照合同约定交付土地，该企业即有权作为原告提起诉讼。
2. 与行政协议有利害关系的其他主体：虽然不是行政协议的直接相对人，但因其合法权益受到行政协议履行的影响，也有权提起诉讼。例如，某行政协议可能影响到相邻方的通行权，该相邻方即可作为原告起诉。

被告主体资格

在行政协议纠纷中，被告主体资格通常属于行政机关。这是因为行政协议是行政机关为了实现行政管理目标而与公民、法人或其他组织签订的，因此行政机关是行政协议的一方当事人。

具体来说，以下几种情形下的行政机关通常具有被告主体资格：

1. 签订行政协议的行政机关：如某市自然资源局与某企业签订了土地使用权出让合同，若该企业提起诉讼，该市自然资源局即为被告。
2. 履行行政协议过程中涉及的其他行政机关：虽然某些行政机关并未直接签订行政协议，但在行政协议履行过程中参与了相关行为或决策，且其行为或决策对行政协议的履行产生了影响，这些行政机关也可能成为被告。例如，某市住建局在行政协议履行过程中作出了影响协议履行的行政行为，若该行为被诉，市住建局即为被告。

综上所述，在行政协议纠纷中，原告主体资格通常属于行政协议的相对方或与行政协议有利害关系的其他主体，而被告主体资格则通常属于签订或履行行政协议的行政机关。若您在具体案件中遇到主体资格问题，建议直接向我咨询，以便获得更准确的法律分析和建议。