金融不良债权转让执行案件中主要存在债权转让合法性、转让程序合规性、以及执行过程中权利义务明确性等方面的问题。具体分析如下：

一. 债权转让的合法性问题

1. 债权转让的有效性：根据《合同法》第八十条，债权人转让权利的，应当通知债务人。未经通知，该转让对债务人不发生效力。在金融不良债权转让中，若转让方未依法通知债务人，或转让合同存在无效情形（如违反法律、行政法规的强制性规定），则债权转让可能无效。
2. 债权转让的合法性审查：执行法院在执行过程中，需要对债权转让的合法性进行严格审查，包括转让合同的真实性、合法性，以及转让过程是否符合相关法律法规的规定。

二. 转让程序的合规性问题

1. 转让程序的透明度：金融不良债权的转让应当遵循公开、公平、公正的原则，确保转让过程的透明度。若转让过程中存在暗箱操作、利益输送等不合规行为，可能损害相关利益方的合法权益。
2. 转让程序的合规性审查：执行法院在审查债权转让程序时，需要关注转让过程是否遵循了相关法律法规和监管要求，是否存在违规操作。

三. 执行过程中权利义务的明确性问题

1. 权利义务的界定：在金融不良债权转让执行案件中，需要明确转让方与受让方之间的权利义务关系，包括债权的金额、性质、担保情况，以及受让方在受让债权后享有的权利和承担的义务。
2. 执行过程中的权利义务纠纷：若转让方与受让方在执行过程中就权利义务问题产生纠纷，可能影响执行效率，甚至导致执行程序的中断或终止。

我建议：在金融不良债权转让执行案件中，相关利益方应严格遵守相关法律法规和监管要求，确保债权转让的合法性和转让程序的合规性。同时，执行法院应加强对债权转让合法性和转让程序的审查力度，确保执行过程的顺利进行。此外，转让方与受让方应明确界定彼此之间的权利义务关系，避免在执行过程中产生不必要的纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。