超过仲裁时效的案件，主要是根据法律规定的仲裁时效期间以及当事人知道或者应当知道其权利被侵害的时间点来判断。以下是对此问题的详细分析：
一. 仲裁时效期间的规定
一般规定：根据《劳动仲裁法》第二十七条第四款，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果当事人在知道自己的权利受到侵害后一年内没有提起仲裁，那么案件就可能超过了仲裁时效。
特殊规定：对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受上述一年时效期间的限制。但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
二. 如何判断是否超过仲裁时效
确定权利被侵害的时间点：首先要明确当事人知道或者应当知道其权利被侵害的具体时间。这个时间点将是计算仲裁时效期间的起始点。
计算仲裁时效期间：从权利被侵害的时间点开始，计算一年（或特殊情况下的更长期间）的时效期间。如果在这个期间内当事人没有提起仲裁，那么案件就超过了仲裁时效。
考虑时效中断、中止的情况：如果时效期间内存在法定的时效中断、中止事由，如当事人一方向对方当事人主张权利、向有关部门请求权利救济等，那么仲裁时效期间将重新计算或中止。因此，在判断是否超过仲裁时效时，还需要考虑这些因素。
三. 超过仲裁时效的后果
如果案件超过了仲裁时效，那么当事人将失去通过仲裁机构保护其民事权利的法定期间。然而，这并不意味着当事人无法再维护自己的权益。在某些情况下，当事人仍然可以通过诉讼、协商或其他途径来寻求解决争议的方法。
我建议，在面对可能超过仲裁时效的案件时，当事人应尽快咨询专业的法律顾问或律师，以便更准确地判断时效情况，并采取相应的法律措施来维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。