赔偿网约车停运损失时，若对维修厂出具的单据不认可，应首先通过协商或法律途径解决争议，并依据相关证据来确定合理的赔偿数额。

一. 分析争议核心

1. 争议点：赔偿网约车停运损失时，关键在于确定合理的停运时间和损失金额。维修厂出具的单据通常是计算停运时间的重要依据，但若双方对此单据不认可，则会产生争议。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人对赔偿数额有争议的，可以请求人民法院或者仲裁机构进行裁决。同时，当事人应当提供充分证据来支持自己的主张。

二. 解决途径

1. 协商解决：

   • 建议：首先尝试与对方进行协商，明确争议点，并尝试达成一致的赔偿方案。可以邀请第三方调解机构介入，以促进双方和解。
   • 生活实例：例如，双方可以约定由另一家双方都认可的维修厂重新出具单据，或者依据网约车的历史运营数据来估算停运损失。

2. 法律途径：

   • 提起诉讼或仲裁：若协商无果，可以依法向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，由法院或仲裁机构根据双方提供的证据来裁决赔偿数额。
   • 证据准备：在诉讼或仲裁过程中，应准备充分的证据来支持自己的主张，如网约车的历史运营数据、维修记录、停运时间证明等。

三. 确定赔偿数额

1. 依据证据确定：赔偿数额应根据双方认可的证据来确定，包括停运时间、网约车日均收入等。
2. 合理计算：若维修厂出具的单据不被认可，应依据其他可靠证据来合理计算停运损失。例如，可以参考网约车近期的平均日收入，乘以停运天数来得出赔偿数额。

我建议：在处理此类争议时，应保持冷静，通过合法途径解决争议。同时，注意收集和保留相关证据，以便在协商或法律程序中维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。