在职员工自己注册公司本身并不直接影响其获得赔偿的权利，但可能间接影响赔偿的具体情形和结果。以下是对此问题的详细分析：
一. 在职员工注册公司与赔偿权利的直接关系
法律未明确禁止：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，并未明确禁止在职员工注册自己的公司。因此，从法律层面讲，员工在职期间注册公司并不直接违反法律规定，也不应直接影响其获得赔偿的权利。
赔偿权利基于特定法律关系：员工获得赔偿通常基于劳动合同、侵权责任等特定的法律关系。只要这些法律关系存在且有效，员工就有权要求赔偿，与其是否注册公司无关。
二. 可能间接影响的情形
竞业禁止或保密义务：如果员工与公司签订了竞业禁止协议或保密协议，并且注册的公司与原公司存在竞争关系或涉及原公司的商业秘密，那么员工可能因违反这些协议而面临法律责任，这可能间接影响其获得赔偿的权利。
忠诚义务与损害赔偿：虽然注册公司本身不直接违反忠诚义务，但如果员工在注册公司过程中利用了原公司的资源、信息或机会，并给原公司造成了损失，那么原公司可能要求员工承担损害赔偿责任。在这种情况下，员工可能因自身行为而减少或丧失获得赔偿的权利。
劳动关系解除或变更：如果员工注册公司的行为被原公司视为严重违反劳动纪律或规章制度，导致劳动关系被解除或变更，那么员工可能因劳动关系的变化而影响其获得赔偿的权利。
三. 总结与建议
综上所述，在职员工自己注册公司本身并不直接影响其获得赔偿的权利，但可能因违反竞业禁止、保密义务或忠诚义务等而间接影响赔偿的具体情形和结果。因此，我建议员工在注册公司前，应仔细审查自己与原公司之间的劳动合同、竞业禁止协议、保密协议等法律文件，确保自己的行为不会违反这些协议或义务，从而避免可能的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。