针对您提出的“虚开发票法院已经判刑并处罚金了，税务还会处理吗”的问题，以下是详细且清晰的解答：
一、明确答案
即使虚开发票的行为已经经过法院判刑并处罚金，税务机关仍然会对此进行处理。刑事处罚与税务处理是两种不同性质且并行不悖的法律责任。
二、刑事处罚与税务处理的关系
刑事处罚：
- 虚开发票构成犯罪的，将依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，处以有期徒刑、拘役或罚金等刑事处罚。
- 刑事处罚是对犯罪行为人的惩罚，旨在维护社会秩序和公共利益。
税务处理：
- 虚开发票导致国家税收流失，税务机关有权要求纳税人补缴相应税款、滞纳金，并可能处以罚款。
- 税务处理是为了恢复税收秩序，确保国家财政收入不受损失。
三、税务处理的具体内容
补缴税款：
- 纳税人需按虚开金额补缴相应的税款。
- 如果虚开发票行为还影响了其他税种，如所得税等，也需一并补缴。
滞纳金与罚款：
- 除补缴税款外，纳税人还需按规定缴纳滞纳金。
- 税务机关还可能根据虚开发票的严重程度对纳税人处以罚款。
税务审计与调查：
- 税务机关可能会对纳税人的账务进行审计，以核实虚开发票的具体情况。
- 在审计过程中，如发现其他税务违规行为，也将一并处理。
四、特殊情况的说明
- 虽然主动补缴税款在量刑时可能作为悔罪态度的一个考虑因素，但这并不能替代刑事处罚或免除税务处理的责任。
- 虚开发票与逃税是不同的法律行为，虚开发票并抵扣的行为一旦发生即构罪，案发后积极补缴税额只能作为量刑时的有利情节，而非出罪条件。
五、总结与建议
综上所述，虚开发票被判刑并处罚金后，税务机关仍会对此进行处理。因此，建议纳税人在面临此类问题时，应积极配合税务机关的调查与处理，主动补缴税款、滞纳金及罚款，以尽量减轻法律后果。同时，也提醒所有企业和个人严格遵守税收管理法规，确保发票的真实性和合法性，避免触碰法律的底线。