结论前置：房产证上只写按份共有但未标注份额，而房屋档案里标注了份额，这种情况下，法律是认可房屋档案里标注的份额的。

分析说明：

1. 房产证与房屋档案的关系：

   • 房产证是房屋所有权的重要证明文件，但它并不是确定房屋产权的唯一依据。
   • 房屋档案是房屋产权登记和管理过程中形成的官方记录，具有更高的权威性和准确性。

2. 份额标注的法律效力：

   • 当房产证与房屋档案在份额标注上存在不一致时，一般以房屋档案为准。
   • 房屋档案中标注的份额，是房屋产权登记部门根据相关法律法规和程序进行确认的，具有法律效力。

3. 实际操作的考量：

   • 在处理房屋产权纠纷时，法院或相关机构会综合考虑房产证、房屋档案以及其他相关证据，来确定房屋的产权归属和份额。
   • 如果房屋档案中明确标注了份额，且该标注符合相关法律法规的规定，那么这份标注通常会被法律所认可。

总结： 因此，房产证上虽然只写了按份共有但未标注份额，但房屋档案里已经标注了份额，那么这份份额标注是具有法律效力的。在实际操作中，如果因此产生纠纷，可以依据房屋档案中的份额标注来维护自己的合法权益。如果你对此类问题还有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。