门店没有国补资质的处罚措施需根据具体资质类型及相关法律法规来确定。以下是对此问题的详细分析：
一. 若国补资质涉及环境影响评价文件的审批
根据《中华人民共和国环境影响评价法》的相关规定：
未依法报批建设项目环境影响报告书、报告表的处罚：
- 依据《中华人民共和国环境影响评价法》第三十一条第一款，建设单位未依法报批建设项目环境影响报告书、报告表，擅自开工建设的，由县级以上生态环境主管部门责令停止建设。
- 根据违法情节和危害后果，处建设项目总投资额百分之一以上百分之五以下的罚款，并可以责令恢复原状。
- 对建设单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分。
建设项目环境影响报告书、报告表未经批准或重新审核同意擅自开工的处罚：
- 依照《中华人民共和国环境影响评价法》第三十一条第二款，建设项目环境影响报告书、报告表未经批准或者未经原审批部门重新审核同意，建设单位擅自开工建设的，同样由县级以上生态环境主管部门责令停止建设。
- 处罚措施与未依法报批相同，即处建设项目总投资额百分之一以上百分之五以下的罚款，并可以责令恢复原状。
- 对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予行政处分。
未依法备案建设项目环境影响登记表的处罚：
- 依据《中华人民共和国环境影响评价法》第三十一条第三款，建设单位未依法备案建设项目环境影响登记表的，由县级以上生态环境主管部门责令备案。
- 处五万元以下的罚款。
二. 若国补资质与其他类型的行政许可或备案相关
若门店的国补资质与其他类型的行政许可或备案相关，如营业执照、价格明码标价等，则处罚措施将依据相应的法律法规进行。例如：
没有营业执照营业的处罚：
- 由工商行政管理部门依法予以取缔，没收非法所得，并处以罚款。
店内没有明码标价的处罚：
- 由价格主管部门责令改正，没收违法所得，并可以并处罚款。
三. 无资质经营的通用处罚措施
根据《无证无照经营查处办法》的相关规定：
无证经营的处罚：
- 对于从事无证经营的，由查处部门依照相关法律、法规的规定予以处罚。
- 如果法律、行政法规对无证经营的处罚没有明确规定的，那么查处部门会责令停止违法行为，并没收违法所得，同时可能会处以1万元以下的罚款。
无照经营的处罚：
- 对于从事无照经营的，由工商行政管理部门依照相关法律、行政法规的规定进行处罚。
- 如果法律、行政法规对无照经营的处罚没有明确的规定，那么工商行政管理部门会责令停止违法行为，并没收违法所得，同时可能会处以1万元以下的罚款。
提供经营场所等条件的处罚：
- 如果明知是对无照经营而为其提供经营场所，或者提供运输、保管、仓储等条件的，由工商行政管理部门责令停止违法行为，没收违法所得，并可以处以5000元以下的罚款。
信用记录与公示：
- 对于从事无证无照经营的单位或个人，查处部门还会将其记入信用记录，并依照相关法律、法规的规定进行公示，这将对违法者的信誉和商业活动产生一定的影响。
我的建议：门店在申请国补资质前，务必确保已满足所有相关法律法规的要求，并依法办理相关审批或备案手续，以避免不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。