关于少发工资的赔偿金如何计算，这确实是一个涉及多个法律法规和具体情形的复杂问题。以下是根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，对少发工资赔偿金计算方式的详细解答：
一、劳动报酬差额的计算（非最低工资标准情形）
- 法律依据：《中华人民共和国劳动法》第五十条。
- 计算方式：少发工资的差额部分 = 应当发放的工资 - 实际发放的工资。其中，应当发放的工资依据劳动合同、公司规章制度或以往支付惯例确定。
- 实例：如小李月工资约定为8000元，实际发放7000元，则差额为1000元。
二、低于最低工资标准的赔偿金计算
- 法律依据：《中华人民共和国劳动法》第九十一条、《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第四条。
- 计算方式：
- 补足差额：当地最低工资标准 - 实际发放工资。
- 赔偿金：（当地最低工资标准 - 实际发放工资）× 25%。
- 实例：如某地最低工资标准为2000元，小张实收1800元，则差额为200元，赔偿金为50元。
三、因拖欠或克扣工资导致解除劳动合同的经济补偿金计算
- 法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条、第四十六条、第四十七条。
- 计算方式：经济补偿金 = 劳动者工作年限 × 解除劳动合同前12个月平均工资（月工资高于当地职工月平均工资三倍的，按三倍计算，且最高不超过12年）。
- 实例：如小王工作3年5个月，平均月工资6000元，则经济补偿金为21000元（3.5年 × 6000元/月）。
四、赔偿金计算的进一步规定
- 法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条。
- 计算原则：若单位未按时足额支付劳动报酬，需按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准加付赔偿金。具体赔偿倍数由劳动行政部门根据实际情况确定。
- 计算步骤：
- 确定实际损失金额（包括工资、奖金、津贴等）。
- 根据实际损失和劳动行政部门的裁定确定赔偿倍数。
- 计算赔偿金总额（实际损失金额 × 赔偿倍数）。
五、特殊情况下的赔偿金计算（恶意拖欠）
- 法律依据：相关法律法规及司法解释。
- 计算方式：在恶意拖欠工资的情形下，赔偿金标准可能更高，甚至可能面临刑事处罚。具体赔偿金数额由法院或劳动仲裁机构根据实际情况裁定。
- 实例：如公司恶意拖欠工资，构成拒不支付劳动报酬罪，除了补发工资外，还可能被判处支付应付金额一倍的赔偿金，并可能面临刑事处罚。
六、维权途径
- 协商解决：首先与公司沟通，要求补发工资及赔偿金。
- 投诉举报：向当地劳动行政部门投诉，请求调查并责令支付。
- 劳动仲裁：若公司未在限期内支付，可向劳动仲裁机构提起仲裁申请。
- 提起诉讼：对仲裁裁决不服的，可向人民法院提起诉讼。
综上所述，少发工资的赔偿金计算是一个综合性的法律问题，需根据具体情况和相关法律法规进行裁定。劳动者在维权过程中应保留好相关证据（如劳动合同、工资单、银行流水等），以支持自己的主张。同时，也建议劳动者在遭遇少发工资等问题时，及时咨询专业律师或法律机构，以获取更具体的法律帮助和指导。