在林地发生纠纷，一方持有林权证，另一方持有土地不动产证的情况下，要确定哪个证件具有更高的法律效力，我们首先需要了解这两个证件的法律定义、作用以及它们之间的效力关系。

土地不动产证，通常指的是土地使用权证，它是确认土地使用权的法律凭证，证明土地使用者对特定土地享有合法的使用权。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，国家依法实行土地登记发证制度，以保护土地所有权和使用权不受侵犯。土地不动产证是土地使用者进行土地开发、利用、经营和交易的法律基础。

林权证，则是县级以上地方人民政府或国务院依据《森林法》的相关规定，对森林、林木和林地进行所有权或使用权的确认，并登记造册后发放的证书。林权证是权利人进行林地流转、林木采伐等经济活动的必备法律文件，其合法权益受法律保护。特别地，根据《林业部关于已获得林权证的林地不再办理土地使用证的复函》，对于已获得林权证的林地，无需再办理土地使用证，林权证即可作为合法的权属证明。

在涉及林地及其上森林资源的权属问题时，林权证具有更高的法律效力。这是因为林权证是专门针对林木和林地权属的证明文件，它涵盖了土地使用证在林地方面的功能。因此，在林地纠纷中，如果一方持有林权证，而另一方仅持有土地不动产证（且该土地不动产证并非专门针对林地），那么通常情况下，林权证会被视为具有更高的法律效力。

当然，在实际应用中，权属争议的处理可能会更加复杂。如果双方对林地的权属存在争议，建议寻求专业的法律帮助，通过法律途径来解决纠纷。同时，也可以咨询当地林业部门或土地管理部门，以获取更具体的指导和帮助。