交通肇事不起诉一般不会有案底，但具体情况需根据不起诉的类型来判断。以下是详细分析：

一、案底的定义

案底，即犯罪记录，是某人过去犯法或犯罪行为的记录，由法院在判决后形成，并伴随个人终身。

二、交通肇事罪不起诉的情形与案底关系

1. 法定不起诉：

   • 情形：包括情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚；依照刑法告诉才处理的犯罪且没有告诉或撤回告诉；犯罪嫌疑人、被告人死亡；其他法律规定免予追究刑事责任等。
   • 结果：不会留下案底。因为本质上不构成犯罪，案件未经法院审判。

2. 酌定不起诉：

   • 情形：犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚。
   • 结果：这种情况下，虽然检察院决定不起诉，但已被认定构成犯罪，只是基于情节轻微等原因不予刑事处罚，因此会留有案底。

3. 证据不足不起诉：

   • 情形：因证据不足不符合起诉条件。
   • 结果：暂时不会留有案底。但若后续发现新证据符合起诉条件并提起公诉，最终被判定有罪，则会留下案底。

三、不起诉后的法律后果

对于交通肇事罪的肇事者，即使人民检察院作出不起诉决定，其仍需对受害方承担民事赔偿责任，包括但不限于医疗费用、误工费以及可能的精神损害抚慰金等。

四、总结与建议

综上所述，交通肇事不起诉是否会有案底，取决于具体的不起诉类型。法定不起诉和证据不足不起诉（若后续无新证据）不会留下案底，而酌定不起诉则会留有案底。

如果您或您身边的人面临类似情况，建议尽快咨询专业律师，以便更准确地了解案件性质和可能的法律后果。同时，无论是否留有案底，都应积极履行民事赔偿责任，以减轻对受害方的损害。