交通刑事案件中，不起诉是否会有案底，主要取决于不起诉的具体类型。以下是详细分析：

1. 法定不起诉（绝对不起诉）

   • 情形：包括情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。
   • 结果：不会留下案底。因为在此类情形下，犯罪嫌疑人根本不构成犯罪或者依法不应被追究刑事责任，案件未经法院审判，自然不会形成犯罪记录。

2. 酌定不起诉（相对不起诉）

   • 情形：犯罪嫌疑人的犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。
   • 结果：可能会留有案底。虽然检察院决定不起诉，但本质上已经认定犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，只是基于情节轻微等原因不予刑事处罚。不过，目前部分地区对于符合特定条件的酌定不起诉案件，会探索进行案底封存等特殊处理方式，以减少对当事人的不利影响。

3. 证据不足不起诉

   • 情形：对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
   • 结果：暂时不会留有案底。因为在此类情形下，只是基于现有证据无法达到起诉的标准，并未经过法院审判认定有罪。但如果后续发现新证据且符合起诉条件，人民检察院可以重新提起公诉，最终被判定有罪的，则会留下案底。

额外提醒：

• 无论何种不起诉类型，交通肇事罪的肇事者均需对受害方承担民事赔偿责任，包括但不限于医疗费用、误工费以及可能的精神损害抚慰金等。
• 不起诉决定并不意味着行为完全合法，只是在特定法律程序下的一种处理结果。如果后续有其他相关情况或再次犯罪，相关记录可能会被重新考虑和处理。

总结建议：

• 如果您或您身边的人涉及交通刑事案件，且检察院作出了不起诉决定，建议根据具体的不起诉类型来判断是否会留下案底。
• 如有任何疑问或需要更详细的法律咨询，比如如何应对可能的民事赔偿、如何了解不起诉决定的具体影响等，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。