针对您提出的“水土保持未批先建项目限期内未补办怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据《中华人民共和国水土保持法》的相关规定，对于在山区、丘陵区、风沙区以及水土保持规划确定的容易发生水土流失的其他区域开办的可能造成水土流失的生产建设项目，生产建设单位应当编制水土保持方案，并报县级以上人民政府水行政主管部门审批。若生产建设单位未编制水土保持方案或水土保持方案未经批准即开工建设，将构成“未批先建”的违法行为。

对于此类违法行为，县级以上人民政府水行政主管部门将依法责令停止违法行为，并限期补办手续。若逾期不补办手续，将依据《中华人民共和国水土保持法》第五十三条的规定，对生产建设单位处以五万元以上五十万元以下的罚款。同时，对生产建设单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员也将依法给予处分。

在处理过程中，水行政主管部门会参照相关法规和政策，如《水利部办公厅关于印发生产建设项目水土保持监督管理办法的通知》中的附件2“水土保持违法行为违法情节及行政处罚自由裁量权参照执行标准”，并结合地方实际情况来确定具体的罚款额度。

此外，值得注意的是，如果生产建设单位在限期内积极补办水土保持方案并获得批准，且主动消除和减轻违法行为危害后果，水行政主管部门可能会考虑免予处罚或减轻处罚。

综上所述，对于水土保持未批先建项目限期内未补办的情况，生产建设单位将面临被责令停止违法行为、限期补办手续以及可能的罚款等处罚措施。因此，建议生产建设单位在开工建设前务必确保水土保持方案已经获得批准，以避免不必要的法律风险和经济损失。