针对您提出的问题“分公司按法定程序签订的施工许可证，总公司未经变更可直接取代吗”，我的回答如下：
不能直接取代。分公司作为总公司的分支机构，在法律上具有一定的独立性，其按照法定程序签订的施工许可证，是分公司作为合同主体所取得的合法权利。总公司并不能直接取代分公司所签订的施工许可证，因为这不仅涉及到合同主体的变更，还可能涉及到相关行政许可、资质审查等法律程序。
具体来说，有以下几个方面的考虑：
合同主体独立性：分公司作为独立的合同主体，其签订的施工许可证是基于分公司的资质和条件获得的。总公司虽然对分公司有管理和指导的权力，但并不能直接取代分公司作为合同主体的地位。
行政许可的特定性：施工许可证是针对特定项目、特定主体颁发的行政许可。如果总公司想要取代分公司成为施工许可证的持有人，可能需要重新申请行政许可，并满足相应的条件和要求。
法律程序的严谨性：任何涉及合同主体变更、行政许可转让等事项，都需要遵循严格的法律程序。总公司未经变更就直接取代分公司所签订的施工许可证，可能会违反相关法律法规，导致法律纠纷和风险。
因此，总公司不能直接取代分公司按法定程序签订的施工许可证。如果总公司需要参与或管理该施工项目，建议通过合法的方式与分公司进行协作或授权，以确保项目的顺利进行和合法权益的保障。如有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。