结论：注册网约车跑了两天后不跑了，商业险是否会赔付，关键在于投保时是否如实告知保险公司车辆将用于网约车运营。

分析说明：

1. 如实告知的情况：

   • 如果在投保时，你已经清楚地向保险公司告知了车辆将会被用于网约车运营，并且按照约定缴纳了对应的保费，那么在保险期间内发生事故，保险公司一般是应该给予赔付的。即使你之后不再跑网约车，保险的理赔也不会受到影响。

2. 未如实告知的情况：

   • 如果在投保时，你没有告知保险公司车辆有用于网约车的使用情况，之后发生了事故，保险公司很可能会以你未如实告知为理由而拒绝赔付。因为保险公司在承保时是基于你提供的信息来评估风险的，如果你隐瞒了重要信息，保险公司有权拒绝赔付。

法律建议：

• 在投保商业险时，务必如实告知保险公司车辆的使用情况，包括是否用于网约车运营。这是确保保险公司在发生事故时能够按照合同约定进行赔付的重要前提。
• 如果你已经投保了商业险，但不确定是否如实告知了车辆的使用情况，建议尽快联系保险公司进行确认，并补充告知相关信息。以避免在发生事故时因未如实告知而面临拒赔的风险。

行动指南：

• 检查你的保险合同和投保单，确认是否如实告知了车辆的使用情况。
• 如有任何疑问或不确定的地方，及时联系保险公司或咨询专业律师（如我）以获取准确的法律意见。