结论前置：开发商将物业用房配置到一期工程楼栋下是否合法，主要取决于相关的规划、合同约定以及法律法规的规定。若规划许可、合同约定及法律法规均未明确禁止此种配置方式，且未对业主权益造成实质性损害，则此举可能合法。但若有违反，则可能不合法。

详细分析：

1. 规划许可角度：

   • 开发商在小区建设时，必须遵循规划部门批准的规划方案。若规划方案中明确规定了物业用房的位置，且该位置不在一期工程楼栋下，则开发商将物业用房配置到一期工程楼栋下是违反规划的行为，可能不合法。
   • 若规划方案中未明确规定物业用房的具体位置，或规划部门批准了开发商对物业用房位置的调整，则此配置方式可能合法。

2. 合同约定角度：

   • 购房者与开发商签订的购房合同中，可能包含关于物业用房位置、用途等条款。若合同中明确约定了物业用房不在一期工程楼栋下，则开发商此举违反合同约定，可能不合法。
   • 若合同中未对物业用房位置作出明确约定，或购房者同意开发商对物业用房位置的调整，则此配置方式在合同层面可能合法。

3. 法律法规角度：

   • 根据相关法律法规，物业用房应满足一定的条件，如面积、位置、设施等，以确保其能正常履行物业服务功能。若开发商将物业用房配置到一期工程楼栋下，违反了相关法律法规对物业用房位置或条件的规定，则此举可能不合法。
   • 若相关法律法规未对物业用房位置作出明确规定，或开发商的配置方式符合相关法律法规的要求，则此配置方式在法律法规层面可能合法。

4. 业主权益角度：

   • 开发商的配置方式若对业主的权益造成实质性损害，如影响业主的通行、安全、隐私等，则可能引发业主的不满和投诉，甚至可能引发法律纠纷。
   • 若开发商的配置方式未对业主权益造成实质性损害，且得到了业主的认可或同意，则此配置方式在业主权益层面可能合法。

综上所述，开发商将物业用房配置到一期工程楼栋下是否合法，需综合考虑规划许可、合同约定、法律法规以及业主权益等多个方面。若您对此存在疑问或争议，建议咨询相关部门或专业律师以获取更准确的法律意见。