代付收据的开具对象主要取决于交易的具体情境和参与方。在一般情况下，代付收据应该开给实际支付款项的一方，即代付方。这是因为代付方是实际承担支付责任并付出资金的一方，开具收据可以作为其支付凭证和会计处理的依据。
以您提供的医药公司代收代付场景为例，如果药品批采平台与第三方持牌金融机构合作，由金融机构统一代收代付交易资金，那么开票流程通常如下：
药品销售方开票：药品销售方在收到款项后，应直接开具发票给药品采购方。这是因为销售方是提供商品或服务的一方，根据税法规定，其有义务向购买方开具发票。
代付方（金融机构）的角色：金融机构作为代付方，虽然实际支付了款项，但并不直接参与商品或服务的交易。因此，金融机构通常不需要开具发票给药品采购方。不过，金融机构可能会向医药公司（即平台方或委托方）提供支付凭证或交易流水，以证明其已履行代付义务。
收据的开具：如果医药公司或平台方需要向金融机构出具收据以确认收到代付的款项，那么这份收据应该开给金融机构。这是因为收据是确认收到款项的凭证，而金融机构是实际支付款项的一方。
综上所述，代付收据应该开给实际支付款项的一方，即代付方。在具体的业务场景中，还需根据交易的具体情况和参与方的需求来确定收据的开具对象和具体内容。如果涉及税务或会计处理方面的疑问，建议咨询专业的税务顾问或会计师。