医院制定各种制度扣医生工资，国家是会进行管理的。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬，保障劳动者的合法权益。医院作为用人单位，其制定的工资制度应当符合劳动法的相关规定，不得随意扣减医生的工资。
   • 同时，根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。这意味着医院在制定扣减医生工资的制度时，必须遵循法定的程序，否则可能构成违法。

2. 国家管理：

   • 国家通过劳动行政部门对医院的工资制度进行监督和检查，确保其符合法律法规的规定。如果医院制定的制度违反了劳动法的相关规定，劳动行政部门有权责令其改正，并可能给予相应的行政处罚。
   • 此外，医生作为劳动者，也有权向劳动行政部门投诉医院的不当行为，维护自己的合法权益。

3. 实际操作：

   • 在实际操作中，如果医院制定了不合理的扣减医生工资的制度，医生可以通过工会或者职工代表与医院进行协商，要求医院改正。如果协商无果，医生还可以向劳动行政部门投诉，或者通过法律途径维护自己的权益。

综上所述，医院制定各种制度扣医生工资是受到国家管理的。医院在制定相关制度时，必须遵循法律法规的规定，并经过法定的程序。如果医院违反了相关规定，国家有权进行干预和管理，以保护医生的合法权益。