结论前置：如果三方就业协议中本人已签字且公司已盖章，但学校未盖章，此时你不想去该公司了，一般情况下是不需要支付违约金的。但具体还需根据协议的具体内容来判断。

分析说明：

1. 协议生效要件：三方就业协议通常需要三方（本人、公司、学校）均签字或盖章后才正式生效。若学校未盖章，从法律角度讲，该协议可能尚未完全生效。

2. 违约金条款的适用性：违约金条款通常是在协议完全生效且一方违反协议约定时才需要支付的。既然协议可能未生效，那么违约金条款也就可能不具备约束力。

3. 具体情况分析：

   • 如果协议中明确规定了“学校盖章后协议生效”，那么在学校未盖章的情况下，你完全有理由认为协议未生效，此时不去该公司无需支付违约金。
   • 如果协议中没有明确规定生效条件，但通常的商业习惯或法律规定要求三方均签字盖章才生效，那么同样可以认为协议未生效，你无需支付违约金。
   • 但如果协议中有其他特殊约定，比如“本人签字和公司盖章后即生效”，那么你可能需要仔细审查协议内容，以确定是否需要支付违约金。

4. 法律建议：

   • 首先，仔细审查三方就业协议的具体内容，特别是关于生效条件和违约金条款的部分。
   • 如果协议内容不明确或存在争议，建议咨询专业律师（如本人）进行进一步分析。
   • 如果确定协议未生效且你不想去该公司，可以与公司沟通协商，明确表达你的意愿，并保留好相关证据，以防后续出现纠纷。

综上所述，三方就业协议中若学校未盖章，你不想去该公司一般不需要支付违约金，但具体还需根据协议的具体内容来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。