关于长期非法占用他人房屋主张房屋占用损失费的诉讼时效计算问题，我可以给出以下详细解答：

结论：房屋占用费追诉遵循一般诉讼时效规定，即三年。该时效从权利人知晓或应当知晓其权利受到损害以及义务人之日起计算。

分析说明：

1. 诉讼时效的起算：

   • 根据相关法律规定，房屋占用费的诉讼时效为三年。这一时效期间的起算点是权利人知道或者应当知道其权利受到损害以及义务人之日。在房屋被非法占用的情况下，若权利人明确知晓房屋被占用且知道占用方是谁，同时意识到自己的权益受损，那么从这一刻起，诉讼时效便开始计算。

2. 诉讼时效的中断与重新计算：

   • 在诉讼时效期间内，如果权利人向义务人提出履行请求，或者义务人同意履行义务，或者权利人提起诉讼或者申请仲裁等，都会导致诉讼时效的中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。这意味着，如果权利人在三年内采取了上述任何一项行动，那么诉讼时效将重新开始计算，而不是继续累计。

3. 诉讼时效的延长与特殊规定：

   • 自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。但特殊情况下，法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。这是为了保护权利人的合法权益，避免因为时效问题而丧失胜诉权。

4. 实际案例的应用：

   • 以小许和小李的案例为例，租赁期满后，小李未搬走也未续租，继续占用房屋。小许在三年多后要求小李支付占用房屋期间的费用。如果在这期间不存在诉讼时效中断的情形，那么小许可能会因为超过时效而丧失胜诉权。因此，权利人应及时主张自己的权利，避免因时效问题导致权益受损。

法律建议：

• 对于房屋被非法占用的情况，权利人应尽快采取措施保护自己的权益。可以通过与占用人协商、提起诉讼或申请仲裁等方式来维护自己的合法权益。
• 在主张权利时，应确保保留好相关证据，如房屋租赁合同、占用期间的费用清单、双方沟通记录等，以便在诉讼或仲裁过程中提供有力的证据支持。
• 如果对诉讼时效或其他法律问题存在疑问，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。