在刑事司法实践中，确实存在被告人涉及多个罪名，但指定管辖只涉及其中一个罪名的情况。以下是对此类案例的详细分析：

核心结论：在被告人涉及多个罪名的情况下，指定管辖可以仅针对其中一个或部分罪名进行，这通常基于司法效率、案件复杂性以及管辖权分配等考量。

案例解析：

假设被告人王某被指控犯有诈骗罪、盗窃罪和故意伤害罪。由于这三个罪名的性质、发生地以及涉及的证据材料各不相同，可能分属不同的法院管辖。为了高效、有序地审理案件，避免管辖权争议和重复劳动，法院可能会根据具体情况，决定对其中一个罪名进行指定管辖。

例如，如果诈骗罪的证据材料最为充分，且该罪名的发生地与某法院有直接的管辖权联系，那么该法院可能会被指定为审理诈骗罪的专门法院。而盗窃罪和故意伤害罪则可能由其他有管辖权的法院分别审理，或者根据后续情况再进行指定管辖。

法律背景：

指定管辖是刑事诉讼法中的一项重要制度，旨在解决管辖权争议、优化司法资源配置、提高审判效率。根据《刑事诉讼法》的相关规定，上级人民法院可以指定下级人民法院审判管辖不明的案件，也可以指定下级人民法院将案件移送其他人民法院审判。这一制度为灵活、高效地处理复杂案件提供了法律保障。

法律建议：

1. 了解案件详情：对于涉及多个罪名的被告人来说，首先要全面了解案件的具体情况，包括每个罪名的性质、发生地、涉及的证据材料等。
2. 关注指定管辖决定：密切关注法院对案件的指定管辖决定，了解哪个法院被指定为审理特定罪名的专门法院。
3. 积极配合调查：在案件审理过程中，被告人应积极配合调查，提供必要的证据材料，以维护自己的合法权益。
4. 寻求专业帮助：面对复杂的刑事案件，被告人可以寻求专业律师的帮助，以获得更全面的法律指导和支持。

综上所述，被告人涉及多个罪名时，指定管辖可以仅针对其中一个或部分罪名进行。这既是司法实践中的常见做法，也是优化司法资源配置、提高审判效率的重要手段。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。