结论前置：诊所医生不在岗时，药师销售药品是否违法，主要取决于销售的是否为处方药以及药师是否具备相应的资格。如果销售的是处方药，且药师未经资格认定或不在岗，那么这种行为是违法的。

详细分析：

1. 处方药的销售规定：

   • 根据《药品经营和使用质量监督管理办法》的规定，经营处方药和甲类非处方药的药品零售单位，应当按规定配备与经营范围和品种相适应的依法经过资格认定的药师或者其他药学技术人员。
   • 药品零售企业营业时间内，依法经过资格认定的药师或者其他药学技术人员不在岗时，应当挂牌告知，未经依法经过资格认定的药师或者其他药学技术人员审核，不得销售处方药。

2. 违法后果：

   • 如零售药店存在“执业药师不在岗销售处方药”等行为，由药品监督管理部门责令限期改正；逾期不改正的，将面临五千元以上五万元以下罚款；造成危害后果的，罚款金额将提升至五万元以上二十万元以下。

3. 实际案例：

   • 有多起药店因执业药师不在岗而违规销售处方药被处罚的案例，这些案例均表明，药师不在岗销售处方药是违法的，且会受到相应的法律制裁。

综上所述，诊所医生不在岗时，如果药师销售的是处方药且未经资格认定或不在岗，那么这种行为是违法的。为了避免法律风险，诊所应当确保在销售处方药时，有依法经过资格认定的药师或者其他药学技术人员在岗并负责审核。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会为您提供专业的解答。