公司注销后章子丢了，别人伪造合同起诉，是有可能被查出来的。以下是对此问题的详细分析：

1. 伪造合同的法律后果：

   • 伪造合同属于违法行为，一旦被发现，伪造者将承担相应的法律责任。
   • 如果伪造合同被用于起诉，法院在审理过程中会进行严格的审查，包括合同的真实性、合法性以及是否存在伪造行为。

2. 公司注销后的章子管理：

   • 公司注销后，其公章、合同章等印章应当按照相关规定进行销毁或移交有关部门保管。
   • 如果章子丢失，公司应当及时报警并公告，以避免被不法分子利用。

3. 查处伪造合同的可能性：

   • 法院在审理案件时，会对合同的真实性进行严格审查，包括比对印章、签名等关键信息。
   • 如果合同存在伪造嫌疑，法院可能会委托专业机构进行鉴定，如笔迹鉴定、印章鉴定等。
   • 一旦伪造行为被证实，法院将依法追究伪造者的法律责任，并可能驳回其诉讼请求。

4. 公司的应对措施：

   • 如果公司发现有人伪造合同并起诉，应当及时向法院说明情况，并提供相关证据以证明合同的伪造性。
   • 公司可以积极配合法院的调查工作，如提供公司注销时的相关文件、印章销毁记录等。

5. 法律建议：

   • 对于公司而言，加强印章管理至关重要。在公司运营期间，应建立健全的印章管理制度，确保印章的安全使用。
   • 公司注销后，应严格按照相关规定处理印章，避免留下安全隐患。
   • 如果遇到伪造合同等法律问题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自身合法权益。

综上所述，公司注销后章子丢失被别人伪造合同起诉是有可能被查出来的。因此，公司在注销后应妥善处理印章，并加强印章管理，以避免类似问题的发生。如果遇到相关法律问题，欢迎随时向我咨询。