年休假期间不应当扣基本工资。下面我将从法律依据、工资计算方式以及特殊情况处理三个角度进行详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条，劳动者在法定休假日期间，用人单位应当依法支付工资。虽然该条款未直接提及年休假，但年休假作为劳动者的合法权益之一，其性质与法定休假日相似。
   • 《职工带薪年休假条例》第二条明确规定，职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。

2. 工资计算方式：

   • 对于固定工资制员工，年休假期间应全额发放工资，不受出勤天数影响。
   • 对于绩效工资制员工，年休假期间的基础工资部分应正常发放，绩效工资部分可能因未实际工作而有所调整，但具体调整方式需依据公司政策和劳动合同约定执行，且不得违反法律法规的强制性规定。
   • 对于计件或计时工资制员工，年休假期间由于未提供实际劳动，因此不计发相应的计件或计时工资，但员工应享有与正常工作期间相同的基础工资或其他固定收入部分。

3. 特殊情况处理：

   • 如果用人单位因工作需要不能安排职工年休假或者跨1个年度安排年休假的，应征得职工本人同意，并按照该职工日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入。
   • 如果员工因个人原因书面提出不休年休假，且用人单位已按照正常工资标准支付了工资，那么用人单位无需再额外支付未休年休假工资报酬。但需注意，这种放弃必须是员工自愿且书面的行为。

综上所述，年休假期间不应当扣基本工资，这是劳动者的合法权益。如用人单位存在侵害员工带薪年休假权益的行为，员工有权通过协商、投诉或劳动仲裁等方式维护自己的合法权益。如果您在这方面有任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。