个人独资企业变更投资人时，主要涉及的税种包括印花税、个人所得税，如果变更涉及到土地、房屋等不动产的权属转移，则还可能需要缴纳契税。

首先，印花税是按照变更合同所载金额的一定比例缴纳的，这个比例通常是万分之五。印花税是对经济活动和经济交往中设立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。

其次，个人所得税是由原投资人在转让股权等资产时需要缴纳的，按照“财产转让所得”项目计算，税率是20%。应纳税所得额是转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额。

最后，如果变更涉及到土地、房屋等不动产的权属转移，那么可能需要缴纳契税。契税的税率根据不同地区和具体情况有所差异，一般在3% - 5%之间。

请注意，税务问题可能因具体情况和地区差异而有所不同，因此在处理税务问题时，建议咨询专业的税务顾问或当地税务机关以获取准确的信息。同时，确保在变更过程中及时办理相关税务手续，以避免可能的税务风险。