是的，二次报价后仍然有可能废标。废标的情况并非仅与报价次数相关，而是涉及到整个招标过程的合规性、公平性以及是否满足招标文件中的实质性要求。

以您提到的情况为例，如果二次报价过程中出现了系统异常，导致部分或所有供应商无法正常报价，这可能会影响到招标的公正性和透明度。在这种情况下，如果专家或招标代理机构认定以一次报价为准，而这与招标文件或磋商文件中规定的二次报价方式不符，那么根据相关法律法规，这样的做法可能是违法的，因此有可能导致废标。

具体来说，根据《政府采购竞争性磋商采购方式管理暂行办法》的规定，如果在磋商过程中发现供应商的报价或其他响应内容不符合要求，或者出现其他影响采购公正的违法、违规行为，采购人或代理机构可以终止磋商，并宣布废标。

因此，二次报价后是否废标，需要根据具体情况来判断。如果招标过程存在违法行为或不符合招标文件的规定，那么废标是有可能的。如果您对此类问题有疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。