两人一起还房贷的扣款方式主要取决于双方的具体约定以及贷款合同的条款。以下是对这一问题的详细解答：

一、扣款方式

1. 共同还款账户：

   • 两人作为共同借款人，通常会设立一个共同的还款账户。
   • 每月需偿还的金额会从这个账户中扣除。
   • 双方需要确保账户中有足够的余额以按时足额还款。

2. 指定扣款账户：

   • 如果贷款合同中明确指定了某一方的账户作为扣款账户，那么每月的还款金额将从该账户中扣除。
   • 这种情况下，另一方需要确保将自己应承担的还款份额转入指定账户。

3. 按份还款：

   • 双方可以约定各自的还款比例，如60%与40%。
   • 按照这个比例，双方分别将各自应承担的还款金额转入共同的还款账户或各自指定的账户。
   • 必须在贷款合同中注明按份还款的相关条款，以防止日后产生纠纷。

二、注意事项

1. 签订书面协议：

   • 无论选择哪种还款方式，双方都应该签订书面协议。
   • 协议中应明确双方的权利和义务、还款责任、房产归属等内容，以保障双方的合法权益。

2. 确保账户余额充足：

   • 双方需要密切关注还款账户的余额情况。
   • 确保在每月还款日前账户中有足够的余额以避免逾期还款。

3. 及时处理还款问题：

   • 如果一方出现还款问题，如经济状况变化导致无法按时还款，应及时与另一方和贷款机构沟通。
   • 双方可以协商调整还款计划或采取其他措施以确保贷款得到按时足额偿还。

三、特殊情况处理

1. 离婚后的还款责任：

   • 如果双方在还款期间离婚，需要协商处理剩余的贷款责任。
   • 根据《民法典》的相关规定，夫妻共同债务应当共同偿还。协商不成的，由人民法院判决。

2. 一方无力偿还：

   • 如果一方因故无力偿还贷款，另一方需要承担剩余的还款责任。
   • 双方可以协商由有能力的一方单独偿还或采取其他措施解决还款问题。

综上所述，两人一起还房贷的扣款方式主要根据双方的约定和贷款合同条款来确定。在还款过程中，双方需要密切关注账户余额情况、及时处理还款问题，并确保签订书面协议以保障各自的合法权益。在特殊情况下，如离婚或一方无力偿还时，需要协商处理剩余的贷款责任。