不动产登记主要由国土资源部门，具体是不动产登记局来负责。这一机构的成立，是根据《中央编办关于整合不动产登记职责的通知》和《中央编办关于国土资源部不动产登记人员编制有关问题的批复》来的，它承担了指导监督全国包括土地、房屋、林地、草原、海域等在内的各类不动产登记工作。

从具体操作层面来看，《不动产登记暂行条例》明确规定，不动产首次登记、变更登记、转移登记、注销登记等各项登记工作，都适用该条例。而且，国家实行不动产统一登记制度，由国务院国土资源主管部门，也就是现在的自然资源部，来负责指导、监督全国的不动产登记工作。

在地方层面，县级以上地方人民政府会确定一个部门作为本行政区域的不动产登记机构，来具体负责不动产登记工作，并且这个机构还需要接受上级人民政府不动产登记主管部门的指导、监督。一般来说，不动产登记是由不动产所在地的县级人民政府不动产等机构来办理的；而在直辖市、设区的市，市人民政府可以确定本级不动产登记机构统一办理所属各区的不动产登记。

所以，如果你需要进行不动产登记或者有相关问题，可以先咨询当地的不动产登记机构或者国土资源部门，他们会根据你的具体情况给出相应的指导和帮助。