公司可以代缴公积金。公积金的缴存是由单位进行的，单位应当依法为职工办理住房公积金账户的设立、转移、封存、注销等相关手续，并按时、足额缴存住房公积金。在职职工个人缴存的公积金，也是由所在单位每月从其工资中代扣代缴的。单位会将单位缴存的和为职工代缴的公积金汇缴到公积金中心在承办银行开设的专户内，由承办银行计入职工个人账户。

如果单位不按规定为职工办理住房公积金相关手续或缴存公积金，职工有权凭有效证明材料申请管理中心督促单位办理。经督促仍不办理的，管理中心可以依职工申请办理。同时，如果单位缴存住房公积金确有困难，也可以按照规定申请降低缴存比例或者缓缴，但每次申请期限不超过1年。

总的来说，公司代缴公积金是法定责任，也是保障职工住房权益的重要措施。如果在这方面有任何疑问或需要进一步的帮助，建议咨询当地的住房公积金管理中心或相关部门。