在办理退休时，如果发现档案里缺少证明材料，您可以按照以下步骤进行处理：

首先，您需要确定缺失的是哪些证明材料。这些材料可能包括工作经历证明、工资单、社保缴费记录等，它们对于核实您的工龄、社保缴费年限以及确定退休待遇等至关重要。

一旦确定了缺失的材料，您可以尝试联系原单位或相关机构，请求他们提供这些材料的复印件或原始记录。如果原单位已经不存在或无法提供所需材料，您可以尝试向当地的人社部门或档案管理机构咨询，看是否有其他途径可以获取这些证明材料。

如果经过努力仍然无法获取缺失的证明材料，您不必过于担心。根据相关规定，如《广东省企业职工基本养老保险的经办规程》中的条款，经办机构在审核历史信息时，若档案原件中缺失信息核定所需佐证材料，他们可以指引您查找相关材料原件并进行审核，或者通过发函等方式向您的相关材料保管单位提出审核要求，请其协助提供相关佐证材料。

在这个过程中，您需要积极配合经办机构的审核工作，提供尽可能多的相关信息和线索，以便他们能够尽快找到并核实所需材料。同时，您也可以咨询当地的人社部门或专业的法律顾问，了解更多的政策规定和操作流程，确保您的权益得到保障。

最后，我想提醒您的是，办理退休手续是一个复杂而细致的过程，需要您耐心、细心地准备和提交相关材料。如果遇到任何问题或困难，不要慌张，及时咨询相关部门或专业人士，寻求帮助和支持。