您好，关于单位土地上自建房拆迁补偿的问题，这是一个涉及多个方面且比较复杂的议题。以下是对此问题的详细解答：
一、自建房合法性认定与补偿原则
首先，自建房的合法性是确定补偿标准的关键因素。
合法自建房：
- 如果自建房已经取得了建设工程规划许可证、土地使用证等相关证件，那么它就被视为合法建筑。
- 拆迁时，您应参照当地的拆迁补偿政策，获得与合法产权房屋相似的补偿，这包括但不限于房屋价值补偿、搬迁费、临时安置费等。
无证自建房：
- 对于未经批准私自建造的房屋，其处理方式会因地区而异。
- 部分地方可能会对满足特定条件（如建造时间早、用于自住、符合一定规划）的无证自建房给予适当补偿。
- 不符合条件的则可能被认定为违法建筑，不予补偿。但即便是违法建筑，拆除时也需遵循法定程序，确保当事人的合法权益不受侵害。
补偿应遵循公平合理、全面评估的原则，确保被拆迁人获得应有的权益。补偿时会全面考虑土地用途、位置、建筑物面积等多方面因素。
二、补偿内容与标准
拆迁补偿通常包括以下几个方面：
房屋价值补偿：
- 被征收房屋的价值补偿应不低于征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。
- 补偿金额会由具有评估资质的机构进行评估确定。
搬迁与临时安置补偿：
- 因拆迁导致的搬迁和临时安置费用必须给予补偿，具体数额及计算方式根据当地实际情况确定。
- 如果政府提供了周转房，则无需支付临时安置费。
停产停业损失补偿（针对非住宅）：
- 如果自建房用于生产经营，因拆迁造成的停产停业损失也应得到补偿。
- 补偿标准可以通过协商或评估来确定。
补助与奖励：
- 政府通常会制定补助和奖励办法，对被拆迁人给予额外的补助和奖励。
宅基地补偿（如适用）：
- 如果自建房涉及宅基地，补偿标准还应包括宅基地区位补偿价、房屋重置成新价等。
三、补偿方式与选择
被拆迁人通常有两种补偿方式可以选择：
- 货币补偿：直接获得相应的补偿金额。
- 房屋产权调换：由政府提供用于产权调换的房屋，并结清差价。
四、特殊情况处理与注意事项
- 历史遗留问题：对于计划经济时代遗留的公房承租等问题，拆迁时应充分考虑承租人的合法权益，确保补偿方案的公平性。
- 补偿主体与分配：拆迁补偿的责任主体通常是实施拆迁的单位或部门。当土地属于单位而房屋由个人出资建造时，应明确房屋价值补偿与土地补偿的归属。
- 法律咨询与维权：面对拆迁问题，被拆迁人应保持冷静，积极寻求法律咨询，并通过合法途径（如行政复议、行政诉讼）进行维权。
综上所述，单位土地上自建房的拆迁补偿问题涉及多个层面和细节。作为被拆迁人，您应充分了解自己的权益和当地的拆迁政策，并积极配合拆迁工作。同时，也要依法维护自身权益，确保获得公平合理的补偿。