针对医保局查到在职执业药师挂证的情况，处理流程通常遵循相关法律法规，并以确保药品安全和公众健康为目标。以下是对此类问题的详细解答：
首先，要明确“挂证”的定义。挂证通常指的是执业药师将个人的《执业药师注册证》挂靠于某个单位，但实际上并不在该单位从事执业活动，或者持证人注册单位与实际工作单位不符。这种行为严重违反了《执业药师注册管理办法》等相关法律法规。
当医保局或相关监管部门发现执业药师存在挂证行为时，会立即启动调查程序。调查过程中，会核实执业药师的实际工作情况、注册信息以及是否存在挂靠行为等关键信息。
一旦确认执业药师存在挂证行为，监管部门将依据相关法律法规进行严肃处理。具体来说，处理措施可能包括：
撤销《执业药师注册证》：根据《执业药师注册管理办法》规定，对于挂证的执业药师，发证部门将撤销其《执业药师注册证》，这意味着该药师将失去执业资格。
限制注册：被撤销注册证的药师，在三年内将不予注册。这是为了对挂证行为进行严厉打击，防止类似行为再次发生。
记录不良信息：挂证药师的个人不良信息将被录入全国执业药师注册管理信息系统，这将对药师未来的职业发展产生负面影响。
法律责任：如果挂证行为构成犯罪，相关部门将依法追究其刑事责任。同时，对于买卖、租借《执业药师注册证》的单位，也将按照相关法律法规给予处罚。
综上所述，医保局查到在职执业药师挂证后，会依法依规进行处理，以确保药品市场的规范和公众用药的安全。同时，也提醒广大执业药师要严格遵守相关法律法规，依法依规从事执业活动。