关于单位请长病假需要什么医院证明的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，单位在要求员工提供病假证明时，应尊重员工的就医选择权。根据相关规定，用人单位无权强行要求劳动者必须前往指定医院就诊，或是提交指定医院的病假单。这是因为医疗费用负担主体已经由用人单位转为社会保险体系中的医保基金，且劳动者有权根据病情、便利情况、以往的病例治疗需要以及专业信任度来选择合适的医院就诊。

因此，对于请长病假的员工，单位应接受由经卫生行政主管部门核准具有资质的医疗机构出具的病假证明。这些医疗机构包括但不限于三甲医院，只要是合法、有资质的医疗机构，其出具的病假证明都应被认可。

在具体操作上，员工在就医后，应向医生说明需要开具病假证明，并按照医院的规定获取纸质版或电子版的病假单。对于电子病假单，员工可以通过医院的线上平台或相关APP进行查阅和下载；对于纸质版病假单，员工则需要在医院指定的地点进行打印和盖章。

最后，员工在提交病假证明给单位时，应确保证明的真实性和完整性。如果单位对病假证明存疑，有权提出质疑并要求员工进行进一步的说明或提供其他相关证明材料。但单位在质疑病假证明时，也应遵循合法、合理、公正的原则，不得侵犯员工的合法权益。

综上所述，单位请长病假需要的医院证明应由经卫生行政主管部门核准具有资质的医疗机构出具，且单位应尊重员工的就医选择权，不得强行要求员工前往指定医院就诊或提交指定医院的病假单。