在办理出生证明时，医院是否会查出生记录，这个问题其实涉及到了出生证明的办理流程和出生记录的管理方式。

首先，我们需要明确出生证明的作用和办理流程。出生证明，即《出生医学证明》，是记录新生儿出生时的健康信息与父母身份的重要法定依据，对于办理户籍登记、接受保健服务、入学注册、出国手续等都具有重要作用。在办理出生证明时，通常需要由儿童父母持有效身份证至相关妇幼保健院或医院的出生证办理窗口进行查询和申请。

接下来，我们来看医院是否会查出生记录。在补办出生证明的流程中，有一项是“调取原《出生医学证明》存根复印件”，这表明在办理过程中，相关部门会查询并核实原始的出生记录。此外，从市档案馆可以查询出生证的情况也可以看出，出生医学证明档案是被集中统一管理和电子化管理的，市民在需要时可以携带身份证进行查询。这也进一步证明了出生记录是被妥善保存并可以查询的。

因此，在办理出生证明时，医院或相关办理机构是会查出生记录的。这是为了确保出生证明的准确性、真实性和合法性，同时也是对新生儿及其家庭权益的一种保障。所以，在办理出生证明时，建议家长提前准备好相关材料，并按照流程进行办理，以确保办理过程的顺利进行。