摩托车扣分是否会扣小车驾驶证的分，取决于驾驶员持有的驾驶证类型。以下是对此问题的详细分析：

1. 合并驾照的情况：

   • 如果驾驶员持有的驾驶证上同时包含小车（如C1驾照）与摩托车（如D或E照）的准驾车型，即已通过增驾考试将准驾车型合并在一本驾驶证上，那么无论驾驶哪种车型违反交通规则被扣分，都会记录在这本统一的驾驶证上。扣分是累积计算的，当在一个记分周期内记分达到12分时，驾驶员需按规定参加学习和考试，否则将面临驾驶证被暂扣等后果。

2. 未合并驾照的情况：

   • 如果驾驶员仅持有小车驾驶证（如C1驾照），并未增驾摩托车（D或E照），则其并不具备驾驶摩托车的资格。在此情况下，若驾驶摩托车被交警查到，将被视为“与准驾车型不符”，这是一种严重的交通违法行为。驾驶员将面临罚款、扣分（通常会扣掉小车驾驶证的9分，依据2022年4月1日新交规实施后的标准）以及摩托车被扣留的处罚。更为严重的是，如果因此发生交通事故，保险公司可能会拒绝理赔，且驾驶员可能需承担刑事责任。

综上所述，摩托车扣分对小车驾驶证的影响取决于驾驶员的驾驶证类型及其是否具备驾驶摩托车的合法资格。为避免不必要的法律风险和损失，建议驾驶员在驾驶任何车辆之前，务必确保自己的驾驶证具备相应的准驾车型，并严格遵守交通规则，以确保自己和他人的安全。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。