当您同时拥有摩托车驾驶证和C1驾驶证，并且这两者已经合并为一本驾驶证（例如C1D或C1E）时，扣分是累积计算的，遵循《道路交通安全违法行为记分管理办法》的规定。以下是对此情况的详细解答：

一、合并驾照的扣分原则

1. 累积计算：无论是驾驶摩托车还是C1准驾车型的汽车，违反交通规则所扣的分数都会累积在合并后的驾驶证上。记分周期为12个月，满分为12分。

2. 统一标准：扣分标准依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，不区分驾驶哪种车辆，违反同一交通规则扣分细则相同。

二、常见交通违法行为及扣分情况

• 扣12分：包括酒后驾驶、伪造或变造相关证件、驾驶与准驾车型不符等严重行为。
• 扣9分：如高速或城市快速路违法停车、未悬挂或故意遮挡号牌等。
• 扣6分：闯红灯、占用应急车道、特定车辆外的机动车在高速公路或城市快速路上超速等。
• 扣3分：不按规定让行、超速行驶（在其他道路上超速20%以上未达50%）、不按规定车道行驶等。
• 扣1分：不系安全带、骑摩托车时不戴安全头盔、不按规定使用灯光等轻微行为。

三、扣分的影响及处理方式

• 扣分未达12分：记分周期结束时，若所处罚款已全部缴纳，则记分清除；若有罚款未缴纳，记分将转入下一记分周期。
• 扣分达到12分：需扣留驾驶证，参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习，并参加科目一考试。考试合格后，记分清除，发还驾驶证；考试不合格，需继续参加学习和考试。
• 扣分超过24分：除需通过科目一考试外，还需进行道路驾驶技能考试（科目三）。

四、特别说明

• 若摩托车驾驶证和C1驾驶证分别持有且均在有效期内，未合并为一本驾驶证，则两者的记分是独立的，互不影响。

五、总结与建议

拥有合并后的驾驶证时，无论驾驶哪种车辆，都应严格遵守交通规则，确保行车安全。同时，建议定期查询驾驶证记分情况，及时处理违章记录，避免因记分累积而影响驾驶证的正常使用。