有薪年休假按二倍计算通常不包含年终奖。

首先，我们需要明确有薪年休假二倍工资的支付情形。根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位在特定情形下（如安排劳动者在休息日工作又不能安排补休时）需要支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这通常指的是劳动者在休息日工作所应获得的加班工资，而非有薪年休假的待遇。

其次，关于年终奖是否计入二倍工资的计算基数，这通常取决于具体的法律规定和劳动合同的约定。在大多数情况下，年终奖被视为一种非常规性奖金，不属于劳动者正常出勤月工资的范畴，因此不被计入二倍工资的计算基数。然而，如果用人单位与劳动者在劳动合同中有明确约定，或者当地法律法规有特别规定，那么年终奖可能会被纳入二倍工资的计算范围。

具体到有薪年休假按二倍计算的情况，这通常与劳动者在年休假期间被安排工作并获得加班工资有关。在这种情况下，二倍工资的计算基数仍然是劳动者的正常出勤月工资，而不包括年终奖。

综上所述，有薪年休假按二倍计算通常不包含年终奖。但请注意，具体情况可能因地区、法律法规和劳动合同约定的不同而有所差异。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见。