不补面积差对办理房产证确实存在影响。通常情况下，购房合同会对房屋面积误差及处理方式有明确约定。如果实测面积与合同约定面积存在差异，按规定可能需要根据面积差情况进行价款结算等操作。

若不补面积差，可能不符合相关办证流程要求。这是因为房地产开发企业在为业主办理房产证之前，需要完成面积实测等一系列手续。如果面积差问题未妥善解决，可能无法提供完整准确的房屋信息，从而导致办证受阻。此外，从产权登记的规范角度来看，面积的准确性是确保产权清晰界定的重要因素。不补面积差可能导致产权面积信息不准确，进而影响房产证的正常办理。

然而，具体情况还需结合当地房产管理规定及实际操作细则来综合判定。在一些特殊情形下，如果面积差较小且符合当地政策规定的豁免条件，也许仍有可能办理房产证。但这需要与相关部门进行充分沟通，并按要求提供相应证明材料，以推动办证事宜顺利进行。

因此，建议您在处理房屋面积差问题时，务必仔细查阅购房合同中的相关条款，并与开发商或相关部门进行积极沟通，以确保您的权益得到妥善保障。如果确实存在面积差异且需要补差价，建议您及时按规定进行补足，以便顺利办理房产证。