顶楼做防水一般不需要邻居同意。下面我将从法律角度和实际操作角度进行详细解释：

法律角度

1. 建筑物区分所有权：根据《民法典》的相关规定，顶楼作为建筑物的一部分，通常属于该建筑物的区分所有权范畴。业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。然而，顶楼的防水层通常被视为建筑物的共有部分或业主专有部分的自然延伸，其维护和管理一般由业主自行负责。

2. 相邻关系：虽然业主在行使自己的权利时，不得危及建筑物的安全，不得损害其他业主的合法权益，但顶楼做防水并不直接涉及对邻居权益的侵害。因此，从相邻关系的角度来看，顶楼业主进行防水处理并不需要邻居的同意。

实际操作角度

1. 物业协助：在实际操作中，顶楼业主进行防水处理时，可能会需要物业的协助，比如提供施工所需的便利、协调施工时间等。但这并不意味着需要邻居的同意，而是基于物业与业主之间的服务合同关系。

2. 沟通协商：尽管法律上没有明确要求，但出于邻里和睦的考虑，顶楼业主在进行防水处理前，可以与相邻业主进行沟通，告知施工计划，以减少可能的误解和纠纷。

综上所述，顶楼做防水一般不需要邻居同意。但业主在进行相关施工时，应遵守相关法律法规和物业规定，确保施工安全和质量，同时尽量与邻居保持沟通，以维护良好的邻里关系。如果有任何疑问或纠纷，可以及时向我咨询，我会提供专业的法律建议。