调休时公司还要扣除相应工资是不合法的。下面我从法律角度为您详细解析：
法律背景
根据《劳动法》及相关规定，员工在法定工作日外加班的，用人单位应当按照法律规定支付加班费或者安排调休。调休，即调整休息时间，是用人单位因工作需要安排员工在法定工作日外加班后，用于补偿员工休息时间的一种方式。
法律分析
调休的性质：
- 调休是员工因加班而获得的合法休息权益，是对员工加班时间的一种补偿。
- 调休期间，员工应当享受与正常工作期间相同的工资待遇，即不应扣除工资。
公司扣除工资的行为：
- 如果公司在员工调休期间扣除工资，实际上是在剥夺员工因加班而获得的合法权益。
- 这种行为违反了《劳动法》及相关规定，属于不合法行为。
法律建议
与公司沟通：
- 首先，建议您与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达您对调休期间扣除工资的不满和质疑。
- 提出您的法律依据，即《劳动法》及相关规定，要求公司纠正不合法行为。
申请劳动仲裁：
- 如果公司拒绝纠正不合法行为，您可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁。
- 在申请劳动仲裁时，请准备好相关证据，如加班记录、调休通知、工资单等，以证明公司的行为违反了法律规定。
寻求法律援助：
- 如果您在申请劳动仲裁过程中遇到困难或需要进一步的法律援助，可以向我咨询或寻求其他专业律师的帮助。
综上所述，调休时公司还要扣除相应工资是不合法的。您应当积极维护自己的合法权益，与公司进行沟通并寻求法律援助。如果有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。